6月14日，南苏丹发布了国家灾害预警公报。公报称，维多利亚湖的水位已飙升至历史最高水平，威胁到下游地区，包括中赤道州、湖泊州、琼莱州、上尼罗河州和团结州。南苏丹将在6月至9月经历异常高温，降雨量也高于正常水平，这可能会加剧一些州的洪灾，估计有250万至300万人面临洪水威胁，对居民生活和粮食安全造成严重影响。

公报指出，预计所有州的气温都将高于正常水平，部分地区气温升高的概率甚至高达90%，这加剧了与高温相关的健康问题风险，并进一步加剧了水资源压力。虽然降雨增加可以提高农作物产量和粮食安全，增加食物的供应量，但也给洪水易发地区带来了农作物受损的风险。

南苏丹国家气象局局长约瑟夫·马库伊表示，政府必须立即采取行动，减轻这些极端天气对居民生活的影响。南苏丹红十字会协调员萨拉·尼扬表示，其团队处于高度戒备状态，正在为大规模洪灾做准备，将协助受灾最严重的社区，特别是低洼地区。与此同时，琼莱州、上尼罗州、联合州、湖泊州和瓦拉卜州等州政府已经开始为防洪做准备。